東方生工在江蘇省科技廳、鎮江市政府和鎮江市科技局的支持下成立了專業的研究與服務機構——江蘇省多功能生物發酵裝備工程技術研究中心。
工程技術研究中心確立了“面向市場，加快技術創新，提高核心技術競爭力”的指導思想，建立了扁平化的組織結構，中心下設中試基地、發酵工藝研究室、電氣設計室、軟件設計室等部門，成立了一個專家委員會。組織機構建立的目的是建立與市場經濟相適應的技術創新體系，形成公司重大科技決策咨詢中心、科研人才培訓中心和科技成果開發、推廣、應用中心，為加快技術創新提供支持與保障。
工程中心投資6000萬元建設了中試基地，建筑面積7000平方米，涵蓋了從菌種保藏、發酵、提取以及產品包裝的生物技術產業化全流程。
工程中心主要配備了以下技術裝備：
菌種擴培區：按美國FDA標準設計，有4個無菌間、3個培養間、1個分析間、3個菌種保藏間；
QC區：按美國FDA標準設計，有3個無菌試驗室（無菌室、微生物限度檢測室、陽性對照室）和一個內毒素室，配有先進的理化分析設備，如紫外、液相、氣相、紅外、原子吸收等進口儀器；
完整的發酵試驗室：配4臺10L自動發酵罐、3套5L-30L二級自動罐、1套50L-500L二級全自動發酵罐；
中試全自動發酵車間：配有2臺500L種子罐、2臺3KL發酵罐、2臺5KL發酵罐、2臺20KL發酵罐以及配料、補料設備；
下游提取設備：包括高速離心、板框、溶煤、水解、沉淀、干燥等全套設備；
配套公用工程：配有溶煤回收、RO純水、廢水處理、氮氣制取、壓縮空氣、蒸汽等；
過程自動化實驗室：生物過程全自動化研究與開發，涵蓋13個參數，包括CER、OUR等；
發酵攪拌系統實驗室：包含攪拌系統設計、流體CFD模擬、攪拌器3D快速打印、攪拌器檢測與驗證系統、攪拌平衡檢測系統等。
